環境Q&A

1ヶ月ほど前から、自宅の庭にもぐらトンネルが発生するようになりました。
敷地はぐるっとコンクリ壁が立ち上がっているので、もぐらは登れるのか？と驚きつつも、これは退治せねばと思い妻に話したところ、「隣の空地がブロック敷きになったので、住む場所がなくなって引っ越して来たんでしょ。ちょっとミミズを食べるだけなんだから良いんじゃない？」との発言でした。
もぐら＝害獣という前提であった私は、根底を覆されて絶句してしまいました。
ネットで調べてみると、やはりもぐらは害獣と言う前提で様々な駆除道具が紹介されていますが、そもそもどんな悪さをするかについては明確に触れられていません。
自分的には、（トンネルによる）景観上の問題は気になりませんが、庭木が駄目にされたり、益虫であるミミズが全滅したりしなければ、住まわせてやっても良いかと考えていますが、実際のところどうなんでしょう？
特に農家では積極的に駆除しているようなので、やはり草花には害があるということなのでしょうか？
ご存知の方よろしくお願いいたします。